海洋沉积物中甲醛耐受菌多样性和一株甲醛降解菌Halomonas sp. JC-5B的初步研究

【摘要】本研究主要通过非培养和可培养手段对东太平洋和厦门近海红树林沉积物中甲醛耐受菌的多样性进行分析。分别直接提取东太平洋深海沉积物甲醛富集样品(AB)和厦门近海红树林沉积物甲醛富集样品(AF)的宏基因组DNA,并以此为模板扩增两样品中甲醛耐受细菌群落的16SrRNA基因,构建16SrRNA基因克隆文库,然后各挑取200个阳性克隆进行16SrRNA基因全序列测定、系统发育树构建,对海洋沉积物中甲醛耐受菌多样性进行了分析和比较。以16SrRNA基因序列同源性>97%为一个OTU(operationaltaxonomicunit)的标准进行分析,AB克隆文库包含了3大门类,共172个单克隆归属于56个OTUs;AF克隆文库包括了12个门类,130个单克隆归属于90个OTUs,其中至少有77.69%的细菌是尚未发现的种。比较发现变形菌门的细菌在两样品中均普遍存在,是海洋环境中的广适类群。不同之处在于AB克隆文库仅含γ-变形菌纲,而AF克隆文库存在α-、γ-、δ-和ε-共4个变形菌纲。覆盖率和多样性指数的计算结果均反映了红树林沉积环境中的甲醛耐受细菌多样性要远高于深海沉积环境。同时通过人工培养方法,对两样品中甲醛耐受菌进行富集,分离、纯化和16SrRNA基因序列鉴定,结果表明,从AB中分离得到的14株甲醛耐受菌,且以盐单胞菌属(Halomonas)为主,而AF中仅分离得到3株,其中有一株新鞘脂菌属(Novosphingobium)的细菌可能为新种。另外,本文对从东太平洋深海沉积物中分离到的一株能高效降解甲醛的嗜盐细菌Halomonassp.JC-5B进行了初步研究,为深海微生物降解甲醛的深入研究和开发利用提供了菌种资源。该菌呈革兰氏阴性,最适生长条件是28℃、pH-9.0、盐度为5%；能耐受50g/L的甲醇；20min内可将50mg/L甲醛降解完全。粗酶液对其它醛类,如乙醛和苯甲醛都能不同程度地降解。通过酶的纯化和全基因组分析结果表明甲醛歧化酶是JC-5B菌株中甲醛降解途径的关键酶之一。该酶分子量大小约为-43k,具有很高的保守性,对甲醛降解能力非常强；且其作用甲醛的最适温度为～40℃,该酶在4℃下稳定性极好,具有良好的应用潜力。上述研究成果为环境中甲醛污染物的生物降解奠定了良好的基础。
【作者】周桂兰；
【导师】徐洵；曾润颖；
【作者基本信息】厦门大学，微生物学，2014，硕士
【关键词】甲醛降解；细菌多样性；深海；甲醛歧化酶；

【参考文献】
[1]张志敏.组织与认同：俄罗斯村社变迁[D].华中师范大学,地方政府学,2012,硕士.
[2]陈集思,武斌,刘云圻.介电层上石墨烯的制备[J].化学学报,2014,03:359-366.
[3]郑敏敏.基于眼电信号检测的人机接口研究[D].清华大学,生物医学工程,2013,硕士.
[4]方刚.分布式多舰载地波超视距雷达数据融合算法的研究[D].哈尔滨工业大学,信息与通信工程,2013,硕士.
[5]王伯平,张会,景大英.分段曲线质量损失模型的研究[J].农业机械学报.2007(02)
[6]朱胜男.违约责任中“三金”的适用关系研究[D].郑州大学,法律,2013,硕士.
[7]谢盛文,谢琨.在基坑工程设计中如何正确利用“杆系有限元法”[J].上海铁道科技.2001(03)
[8]张燕.吸烟危害认知对戒烟成功影响的中介效应和调节效应分析[D].山东大学,公共卫生（专业学位）,2013,硕士.
[9]陈中华,王建川,余飞,张正国,高学农.氧化石墨烯/密胺树脂复合材料的制备及其热性能研究[J].功能材料,2015,01:125-128+134.
[10]倪婭嵐.《睡虎地秦簡》用字頻度研究[D].西南大学,漢語言文字學,2013,硕士.
[11]孙国臣.基于Android系统的139邮箱的设计与开发[D].山东大学,电子与通信工程（专业学位）,2013,硕士.
[12]布朗森（BransonQuenzer）.中美消费者绿色消费的比较研究[D].哈尔滨工业大学,政治经济学,2014,硕士.
[13]张大伟,郭烜,韩臻.安全可信智能移动终端研究[J].中兴通讯技术.
[14]毕强.长春市伊通河污水主管道改造工程设计研究[D].吉林大学,环境工程,2014,硕士.
[15]马春祥.黄土地区沟谷地形桥梁全寿命周期成本分析[D].长安大学,建筑与土木工程（专业学位）,2014,硕士.
[16]林张军.OxLDL诱导巨噬细胞Nogo-B表达上调及其机制研究[D].第二军医大学,药理学,2013,硕士.
[17]罗燕.崇明瀛东村盐碱地改良示范区内人工草坪土壤动物群落结构研究[D].华东师范大学,生态学,2013,硕士.
[18]陈珺.提高Darrieus型风力机风能利用率方法的数值研究[D].上海大学,流体力学,2014,硕士.
[19]王瑶.关于七福神中福禄寿和寿老人的考察[D].首都师范大学,日语语言文学,2013,硕士.
[20]郑军.基于工序碳源的砂型铸造碳排放及碳效率建模研究[D].浙江大学,机械制造及其自动化,2014,博士.
[21]张丽.基于Boosting技术的显露模式集成分类算法[D].湖南大学,计算机技术,2011,硕士.
[22]路凯.基于综合比率因子的互信息特征选择方法的改进[D].华中师范大学,计算机应用技术,2014,硕士.
[23]张治.基于Network Simulator V2的移动自组网研究[D].西北工业大学,模式识别与智能系统,2004,硕士.
[24]鄢宁.YHJY公司人力资源管理体系优化的研究[D].吉林大学,项目管理,2012,硕士.
[25]杨哲.基于安全社区建设的安全生产监管研究[D].大连理工大学,行政管理,2013,硕士.
[26]宁晓然.从预设角度分析赵本山小品中的幽默[D].辽宁大学,外国语言学及应用语言学,2012,硕士.
[27]李乐,齐敏友,宋英.PBL与Seminar相结合教学法在药学专业本科生临床医学概论课堂教学中的实践[J].中国高等医学教育,2014,01:101-102+127.
[28]张寿荣,高翔,王秋美.活性碳纤维净化空气研究概述[J].上海毛麻科技,2014,02:44-46.
[29]柴健.磁流变阻尼器对近海风机的振动控制研究[D].大连理工大学,防灾减灾工程及防护工程,2013,硕士.
[30]孟超.网上阅卷系统中答题卡模板自动生成技术研究[D].湖南师范大学,软件工程（专业学位）,2013,硕士.
[31]崔若飞.基于ARM和GPRS智能家居监控系统的设计与研究[D].北京交通大学,2009.
[32]唐玉.中西文化对默顿科学规范的影响研究[D].华中科技大学,科学技术哲学,2012,硕士.
[33]张郑兵.闪锌矿CdSe量子点的自旋动力学研究[D].上海大学,光学,2013,硕士.
[34]卢懿.中美工程研究中心比较研究[D].广西大学,科学技术哲学,2004,硕士.
[35]陆强.转型视角下中国国有企业治理法律研究[D].山东财经大学,民商法学,2014,硕士.
[36]孙薇.在荒谬世界中呼唤革命[D].四川外国语大学,英语语言文学,2013,硕士.
[37]马文聪,侯羽,朱桂龙.研发投入和人员激励对创新绩效的影响机制——基于新兴产业和传统产业的比较研究[J].科学学与科学技术管理,2013,03:58-68.
[38]刘晓敬.中国农村社会养老保障模式的选择[D].天津财经学院,金融学,2004,硕士.
[39]李景义.人格权基本理论问题研究[D].黑龙江大学,民商法学,2014,博士.
[40]何兴学.醋酸钠结晶动力学研究[D].浙江工业大学,2012.
[41]江夏.从精准性原则看法律词汇的英汉翻译策略[D].北京外国语大学,翻译,2013,硕士.
[42]郝捷.FF公司市场营销策略分析[D].厦门大学,工商管理,2014,硕士.
[43]李晶.公租房建筑设计研究[D].北京建筑大学,建筑学,2013,硕士.
[44]朱玉全,孙志挥.大型事务数据库中的一种快速的规则挖掘算法[J].计算机科学,2002,10:59-60+69.
[45]吴蕾蕾.邻避现象研究综述[J].现代妇女(下旬),2014,06:262-264.
[46]朱磊.勘察设计院集成化的图档管理信息系统研究[D].山东科技大学,2003.
[47]万学森.基于作业成本法的成本管理信息系统研究[D].北京交通大学,2012.
[48]李晶哲.仙台病毒缺损干扰颗粒抗大鼠脑胶质瘤初步研究[D].天津医科大学,病原生物学,2009,硕士.
[49]吴雨莲.镁合金—钢无匙孔搅拌摩擦点焊机理研究[D].兰州理工大学,材料加工工程,2013,硕士.
[50]陈佳.北京市网球消费者及其消费行为分析[D].北京体育大学,体育教育训练学,2013,硕士.